多药耐药性绿脓菌(Multiple – Drug – ResistantPseudomonas aeruginosa:MDRP),是主要的抗生素对获得了广泛耐药性绿脓菌,分离报告和院内感染的事例,各地的医疗设施多被报告。
爱知县卫生研究所的铃木匡弘老师和金泽医科大学的老师们由嗣饭沼开发的PCR -根据ORF Typing(POT)法,多路PCR用绿脓杆菌中的多数特定基因领域进行放大、琼脂糖凝胶电泳增幅被的乐队图形分析方法。
这个方法的基础上,本试剂盒,绿脓菌基因领域的符号简便数值化的可能。
脉冲电场凝胶电泳(PFGE)和Multilocus Sequence Typing(MLST)法和同等的识别能力具有。
*参考:厚生劳动省科学研究费补助金新型流感等新兴·复兴感染症研究事业,新型耐药性菌関研究平成23年度总结·分担研究报告,研究代表荒川宜親
特长
约4小时的分子疫学分析可能
脉冲电场凝胶电泳(PFGE)不同的通用设备测定可能
解析结果数值化(POT值)的事,菌体间的相比较可能同性
配套元件的构成
|
个别名称 |
容量 |
数量 |
试剂A |
AptaTaq DNA主人(5×Conc .)* |
500μL |
一本书 |
试剂B |
PCR附录 |
500μL |
一本书 |
试剂C |
引物混合α |
250μL |
一本书 |
试剂D |
混合β引物 |
250μL |
一本书 |
试剂E |
积极控制 |
250μL |
一本书 |
试剂F |
6×装入缓冲区(BPB·XC) |
500μL |
一本书 |
* AptaTaq DNA主人(5×Conc设置Roche Diagnostics K . K .的商品。
操作步骤
① |
绿脓菌块儿的(培养) |
② |
DNA抽出,进行模板DNA制备 |
③ |
两种多路PCR |
④ |
琼脂糖凝胶电泳 |
⑤ |
乐队的读取模式 |
差 |
POT值的计算 |
⑦ |
各样品的POT值的比较分析 |
解析
电泳模式
50 : 50个基点DNA梯形P:积极的控制1:ATCC®27853
2:ATCC®355543:PAO 14:IMP阳性临床分离股票5:VIM阳性临床分离股票6:临床分离股票7,8:集体感染事例1中所得到的临床分离股票9,10:集体感染的事例2从中得到的临床分离股票
泳动条件,是4%琼脂糖KANTO A的酒馆熊猫聚会(0.5×TBE缓冲液),电泳装置用,120 V 50分钟。25孔的梳子,用样品3μL电器了泳动了。
检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸
|
POT No . |
放大尺寸(bp) |
目标领域 |
Reactionmixture 1 |
PCR PC |
506 |
positive control <em>aeruginosa P .</em> |
POT 1 – 1 |
336 |
Genomic Islet – 1 |
POT 1 – 2 |
281 |
Genomic Islet – 2 |
POT 1 – 3 |
235 |
Genomic Islet – 3 |
POT 1 – 4 |
201 |
Genomic Islet – 4 |
POT 1 – 5 |
175 |
Genomic Islet – 5 |
POT 2 – 1 |
151 |
VIM |
POT 2 – 2 |
126 |
职业噬菌体- 1 |
POT 2 – 3 |
103 |
职业噬菌体- 2 |
POT 2 – 4 |
85 |
职业噬菌体- 3 |
Reactionmixture 2 |
PCR PC |
506 |
positive control <em>aeruginosa P .</em> |
POT 1 – 6 |
324 |
Genomic Islet – 6 |
POT 1 – 7 |
271 |
Genomic Islet – 7 |
POT 1 – 8 |
238 |
Genomic Islet – 8 |
POT 1 – 9 |
204 |
Genomic Islet – 9 |
POT 1 – 10 |
176 |
Genomic Islet – 10 |
POT 2 – 5 |
150 |
职业噬菌体- 4 |
POT 2 – 6 |
124 |
职业噬菌体- 5 |
POT 2 – 7 |
105 |
IMP |
PCR PC,绿脓杆菌检测用的PCR积极控制指。
①2个多路PCR的电泳结果从乐队读取模式。
②这电泳乐队的有无的结果用,POT值分析用EXCEL表二进法输入,2个类别的POT值计算出。
无论PCR电脑阳性的情况,那个样品是绿脓菌,可以确认。另外,MDRP的场合,POT 2的值的合计为64以上或奇数。
不论样品之间的POT值进行比较,菌体间的相同性客观的推测。
在集体感染得菌身体,POT 1~2 POT值全部同一。
范畴 |
样品号码 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
POT 1 |
636 |
572 |
可以 |
646 |
207 |
887 |
410 |
410 |
646 |
646 |
POT 2 |
48 |
58 |
0 |
9 |
122 |
6 |
8 |
8 |
8 |
8 |
产品信息
产品名 |
包装 |
产品编号 |
鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(绿脓菌用) |
一包(50次) |
08187 – 96 |
鹿genius®DNA抽出试剂 |
一包(120次) |
08178 – 96 |
最新的价格是Cica – Web请参照。
本试剂盒是从爱知县专利许可,制造销售。其他厂家的商品相关的许可证、专利方面,各厂商请确认。
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产品名 |
包装 |
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10张 |
72108 |
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包装 |
产品编号 |
琼脂糖KANTO A的酒馆熊猫聚会了 |
100克 |
01089 – 23 |
10×TBE缓冲液 |
一L |
46510 : 79 |
溴化乙锭溶液(2毫克/毫升瓶装),眼药水 |
10毫升 |
14575 : 43 |
Quick‐Load Purple 50个基点DNA Ladder |
gel lanes
250 |
49914 : 40 |
6倍浓缩装入缓冲器 |
2 mL×6本 |
24080 – 96 |
最新的价格是Cica – Web请参照。
宣传手册、说明书(PDF)
小册子鹿genius®分子疫学解析配套元件(绿脓菌用)(399 KB)
小册子鹿genius®POT套件系列(1.3 MB)
小册子鹿genius®基因检测试剂盒推荐组套(978 KB)设备
小册子基因检测相关产品指南(2.3 MB)
取扱说明书(971 KB)
计算表(ZIP文件,Excel)
POT值分析用EXCEL表(ZIP文件,522 KB)
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